Скважины используются для получения первых проб воды и ее лабораторного исследования на соответствие санитарно-эпидемиологическим нормам, затем — для оценки запасов, расчета способности одной или нескольких подземных выработок удовлетворить нужды конкретного водозаборного узла, и наконец — для добычи подземных вод в ходе эксплуатации ВЗУ. Также требуется регулярный контроль за состоянием водоносных горизонтов: через основные действующие или отдельные наблюдательные скважины.